银耳栽培管理可分为菌丝生长，子实体形成、子实体发育及担孢子形成四个阶段。在各个阶段，银耳的生长特点和对环境条件的要求有所差别，管理上应采取相应的措施。
(1)菌丝生长阶段
按种后1—12天为菌丝生长阶段。其中1-4天为发菌期，需要氧气较少，可采取密封培养的办法，保持接种口密封，并置于干燥的菌丝繁殖室进行培养，以防止杂菌进入接种口。
过6天后，室内要进行微量通风，以适应菌丝生长。
(2)子实体形成阶段
接种后13～20天为子实体形成阶段，需要较多的氧气，较高的温度和较强的光照，此阶段可敞开培养，把瓶口的薄膜拿掉，换上能透气的牛皮纸套筒；
袋栽的可将接种口上的胶布掀开一小角，让新鲜空气进入菌丝体内，并把它移放于多湿的予实体分化室内培养。
(3)子实体发育阶段
接种后21-40天为子实体发育阶段，此阶段要求有充足的湿度，氧气和光照，以促进耳片健壮伸展。
