日前，中国科学院微生物研究所赵瑞琳课题组首次把真菌的演化时间应用于确定分类等级和分类系统重建工作中，制定了演化时间作为确定分类等级的一个新标准。她说：“在划分单系类群的分类等级时，相同分类等级的演化时间应大体一致；高分类等级的演化时间要早于低分类等级的原则。”相关论文已发表于真菌学领域的权威期刊。
赵瑞琳介绍了该研究思路首先在种类及进化支序繁多的蘑菇属上应用，具体工作为：在700余世界各地样品初步的系统发育分析的基础上，以两个伞菌纲化石标本为演化时间校订点，通过多基因序列的分子钟分析，确定蘑菇属演化形成于6600万年前；在3000万年前形成6个单系支序（被命名为亚属）；在2000万年前左右，进一步分化出的22个单系支序（被命名为组）；而其他单系支序由于形成时间明显晚于上述时间，不被划分为任何一个种上分类单元，最终重建了蘑菇属的世界性分类体系，解决了蘑菇属内大量新进化分支的命名分类难点。
赵瑞琳说：“我们首先集结近十年来担子菌门的最新进展，分别构建了担子菌门6个基因的系统发育图谱，及基于396个直系同源基因的系统发育图谱。”
随后的分子钟分析表明担子菌门演化形成于5.3亿年前，担子菌门中4个亚门的演化时间为4亿~4.9亿年前，对于具有大型子实体的伞菌纲的演化时间范围分别为3.4亿~3.9亿年前，具有较小子实体的锈菌亚门和黑粉菌亚门中纲的演化时间范围分别为2.4亿~3.4亿年前；担子菌门中各个目的演化时间为1.2亿~2.9亿年前。
因此，赵瑞琳建议把这些演化时间作为建立担子菌门中目及目以上分类等级的一个依据。借助于演化时间这一新标准，还新认定一个亚门Wallemiomycotina；发现1个目由于过于年轻的演化时间建议废除；2个科由于具有的古老演化时间，分别正式提升为2个目。
赵瑞琳课题组的研究表明，演化时间可以成为划分真菌分类等级的一个新标准，而且给出了担子菌门划分亚门、纲、亚纲和目的演化时间范围标准。此研究方法为解决大量发现的新进化支序的合理分类问题，制定更客观和稳定的分类系统提供新的依据，目前已在其他类群（如子囊菌门，表生真菌等）的系统学研究中采用。
